根据中科院各机关官网的介绍，新设的前沿科学与基础研究局负责数学、物理学、化学、天文学、力学、生命科学、基础前沿交叉等领域的学科建设、发展规划、科研平台建设与管理，相关领域重大科技任务的培育、争取、组织、协调与管理等。该局内设综合业务处、数学与交叉科学处（香山科学会议办公室）、物理与化学处、天文力学处、生命科学处。
科技基础能力局负责科技基础能力建设的统筹规划与组织协调；负责重大科技基础设施建设与管理；负责野外台站管理；负责科技条件建设；负责网络与信息化建设管理；负责科学数据系统的建设运维、开放利用等工作；负责文献情报管理；负责学术期刊与出版管理等。该局内设综合业务处、重大设施处、科技条件处、网络与信息化处、科学数据处、文献情报与期刊处。
财务与资产管理局负责经济资源配置规划、政策和制度的制定实施；负责财务与资产管理；负责预算绩效管理与财务监管；负责科研园区规划、基建投资规划和年度计划、基本建设管理；负责后勤支撑体系建设与保障；负责院机关财务管理等。该局内设综合处、预算处、资产财务处、资金绩效与监管处、投资与基建项目处、后勤保障处、机关财务处。
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