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据国家林草局统计，自第一批国家公园设立以来7168网站，东北虎豹国家公园内野生东北虎达到70只左右，野生东北豹达到80只左右，2023年新增野生东北虎幼崽20只、野生东北豹幼崽15只。大熊猫野外种群总量从20世纪80年代约1100只增长到近1900只。三江源地区藏羚羊种群数量恢复到约30万只，保护级别从“濒危”降为“近危”。武夷山国家公园新发现雨神角蟾、福建天麻、武夷林蛙等多个新物种。海南长臂猿种群数量由5群32只增长到6群37只，是全球现存10只以下极危物种中，唯一基于自然恢复的成功案例。

亚洲象野外种群增至300多头，朱鹮分布区从3个省扩展至8个省，种群数量超过9000只，中华穿山甲分布点位不断增加，全国麋鹿分布点从引入时的2个发展至93个，麋鹿种群数量已达上万头。华盖木由最初发现时的6株增长到1.5万株，巧家五针松由最初发现时的34株增长到3000多株，百山祖冷杉从最初发现时的3株成功野外回植4000多株。