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作为中国重要的自然地理过渡带和世界地质奇观，邛崃市所在的龙门山是全球36个生物多样性热点地区之一，拥有万余种动植物，被誉为“自然科学宝库”。数据显示，邛崃市有记录植物2965种，其中红豆杉、南方红豆杉、珙桐等国家重点保护野生植物26种；已记录动物775种，其中乌雕、林麝、毛冠鹿等国家重点保护野生动物41种。
在珍稀植物与昆虫探索馆，不仅有红豆杉、伯乐树等国家一级保护植物，异颖草、四角刻叶菱、金荞麦等国家二级保护植物，还有“植物界的大熊猫”——距瓣尾囊草以及珍稀兰草与蕨类植物。“龙门山是新生代孑遗植物的家园，这里展陈的连香树、水青树等，同样是新生代第三纪留下的孑遗植物。”张博说，这些珍稀孑遗植物，与槭树、铁杉、岷江柏木、毛樱桃等树种多彩混交，共同把龙门山装点得生意盎然。
在龙门山珍禽异兽与鱼类探索馆，游客可以清晰地看到龙门山峡谷鱼群、鸟群和兽群的成长路径。沿着河水溯流从源，可以通过裂腹鱼、鰋鮡、胭脂鱼等鱼类独特的外形找到自然进化的奥秘；行走山林小径，两侧的山溪鲵、文县疣螈、潘氏闭壳龟、脆蛇蜥、菜花原矛头蝮等栩栩如生；仰望天空，黑颈鹤成群离开越冬地云贵高原，北上迁至龙门山繁殖后代。
“龙门山还是现存野生大熊猫、川金丝猴、羚牛、小熊猫、绿尾虹雉等一大批稀濒野生动物的集中分布区，是濒危特有兽类的生命浮山。”从天津远道而来的游客王梦先感慨，来到这里才知道，龙门山区域的邛崃山系和岷山山系就包含了目前世界上还残存野生大熊猫的六大山脉中拥有数量最多的连续野生种群，以及适合大熊猫栖息的最大面积潜在生境。
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